Сотрудничество Республики Таджикистан с Управлением Верховного Комиссара ООН по делам беженцев (УВКБ ООН) началось в 1993 году по приглашению Правительства страны с целью оказания содействия в возвращении беженцев и внутренне перемещённых лиц в места их постоянного проживания.
Республика Таджикистан стала первым государством в Центральной Азии, присоединившейся к Конвенции 1951 года и Протоколу 1967 года о статусе беженцев, начав развивать национальную систему предоставления убежища. В связи с этим, с первых дней своей деятельности в Таджикистане, УВКБ ООН сотрудничает с Правительством с целью создания надежной системы предоставления убежища, а также обеспечения защиты и оказания помощи беженцам и лицам, ищущим убежище в Таджикистане.
Деятельность УВКБ ООН в Таджикистане осуществляется на основании Соглашения о сотрудничестве между Правительством Республики Таджикистан и УВКБ, подписанного в мае 2002 года.
В марте 2022 года состоялся визит Верхового комиссара ООН по делам беженцев Филиппо Гранди в Таджикистан, в рамках которого были проведены ряд встреч с высокопоставленными лицами.
Основанная в 1951 году в качестве межправительственной организации в области миграции, Международная Организация по Миграции (МОМ) работает в тесном сотрудничестве с правительственными, межправительственными и неправительственными организациями-партнерами. Организация помогает в вопросах обеспечении гуманного и упорядоченного управления миграцией, оказывает поддержку нуждающимся мигрантам, а также оказывает содействие в поиске практического решения проблем в данной области.
В 1994 году Таджикистан стал государством-членом МОМ, и в том же году было подписано Соглашение о сотрудничестве между Правительством страны и этим учреждением ООН.